Ich würde pauschal behaupten das es an den Stellmotor(en) liegt.
Ich habe einen Golf IV Variant, und auch hin und wieder das Problem das die hintere linke Tür nicht aufgeht, bzw. der Knopf geht nicht hoch.
Wenn die Heckklappe beim Variant mal nicht aufgeht, einfach mal gegen das VW Zeichen hauen, dann arbeitet der Stellmotor auch wieder.Ist bei mir jedenfalls so.